養樂多在今年7月2日就創下日職史上最快點亮魔術數字「53」的紀錄，且各項投打數據都在聯盟名列前矛。在此之前，絕大多數人都認為今年央聯霸主將是養樂多的囊中物。但故事的發展，永遠不會如大家的預期，養樂多先是在7月6日在東京巨蛋吞下二連敗，讓連續對戰組合勝利的數字止步於14，接下來7月8日對上阪神，遭本季央聯最強投手青柳晃洋完封。不過最慘的並不是這個，7月9日球隊一口氣爆發14名球員、教練以及隊職員感染武漢肺炎確診，其中更是包含了總教練高津臣吾、投教石井弘壽、主力先發選手山田哲人、長岡秀樹、青木宣親，牛棚勝利方程式清水昇、田口麗斗等人，當晚和阪神的比賽直接延期，隔天再度擴大採檢範圍，確診成員再加上中村悠平、塩見泰隆等主力選手。其中一軍三名捕手全部確診，固定先發打者也只剩下村上宗隆、洋砲Osuna以及山崎晃大朗。想當然爾7月10號的比賽再度中止。
雖然早在一軍疫情大爆發之前，養樂多二軍就已經有部份選手確診，只是依照聯盟規定，如果支配下選手足以支援一場比賽所需人數時，比賽無法繼續延期，因此雖然養樂多總計有27人確診，但還是湊得出一軍名單，因此從7月12日起和中日的三連戰，養樂多必須用所謂的「一二混合軍」作客中日。但或許是幸運之神依舊眷顧著球隊，系列賽中唯一一場在室外球場的比賽因此延期，也讓球隊賺到了一場休息。
或許有過兩次確診的緣故，村上成為少數在這波大流行中存活下來的先發選手。但實際上剛拿下交流賽和六月份MVP的村上，進入七月後表現並不理想，在七月份的前七場比賽當中，村上只擊出了5支安打，長打也只有1支，全壘打和打點則是完全沒有進帳。但就在球隊大量確診的同時，唯一的「倖存者」村上表示自己會扛下主力隊友缺陣時的重責大任。5天過後的首場比賽中，村上面對中日隊的小笠原慎之介，首打席就轟出了個人七月份首轟——帶有兩分打點的全壘打，讓球隊有個不錯的開始，雖然最終沒能贏球，球隊也在7月14日輸球後讓魔術數字消失，但在七月初表現不佳的村上，逐漸找回自己的手感。明星賽前的村上，單月全壘打累積到了4支。
養樂多下半季第一個系列戰就是遠征甲子園，面對在明星賽前夕最具話題性的阪神。雖然養樂多本季在客場迎戰阪神總是勝多敗少，但此時的阪神早已不可同日而語，在4月中旬一度「借金」（敗場扣掉勝場）高達16的阪神隊，靠著強大的投手戰力力爭上游，在明星賽前最後一個系列賽於主場橫掃DeNA，讓勝率回到五成，是央聯近況最理想的球隊。養樂多雖然遙遙領先，但主力選手多從疫情中歸隊，戰力不如以往，兩隊戰績和近況洽成反比，對阪神來說是個縮小差距的大好機會。果然前兩場比賽，阪神靠著堅強的投手陣容，只讓養樂多拿到3分，輕鬆拿下二連勝，和養樂多的勝差也縮小到個位數9。村上雖然在系列賽第二戰中開轟，但僅僅是杯水車薪，無法影響最後的結果。
關鍵性的第三戰，養樂多若再輸，勝差將縮小到8，且面對和第二名的「天王山之戰」，若吞下三連敗，將對士氣有嚴重的打擊。只是面對在甲子園有主場一直有穩定表現的洋投Gunkel，養樂多依舊束手無策，沒能攻下任何分數，反觀氣勢如虹的阪神，在第四局靠者連續安打和犧牲打先下兩城。對於牛棚自責分率不到3，七月甚至不到2的阪神投手群而言，2分似乎已經足夠。但前兩打席沒有表現的村上確不如此認為。七局上半，面對第一任中繼左投渡邊雄大的外角滑球，村上一棒順勢把球推出了左外野全壘打牆，1:2，養樂多把差距縮小到一分。
9局上半，阪神派出守護神岩崎優，在此役之前，岩崎在七月份拿下了8次救援成功並一分未失，本季尚未被在例行賽期間被擊出全壘打，只有在日前的明星賽被軟銀的柳田悠岐轟出一發。不過這次的對決，村上直接鎖定岩崎投出的內角偏高的直球，一棒掃出全壘打大牆外，讓比賽重新開始。延長11局上半，村上再度扮演了英雄的角色，投手石井大智的一計偏高曲球，被村上一棒轟出左外野牆外，這發全壘打不僅逆轉了戰局，讓養樂多逃過被橫掃的命運，這也是村上職棒生涯的首次三連轟。
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